Lembaga Layanan Pendidikan Tinggi (LLDIKTI) adalah lembaga yang berada di bawah dan bertanggung jawab kepada Menteri Pendidikan, Kebudayaan, Riset dan Teknologi. LLDIKTI dibentuk pada tahun 2018 melalui Permenristekdikti Nomor 15 Tahun 2018 sebagai implementasi dari Pasal 57 Undang-Undang Nomor 12 tahun 2012 tentang Pendidikan Tinggi, yang menegaskan LLDIKTI sebagai satuan kerja Pemerintah di wilayah yang berfungsi membantu peningkatan mutu penyelenggaraan Pendidikan Tinggi. LLDIKTI merupakan transformasi dari Koordinasi Perguruan Tinggi Swasta (KOPERTIS).
LLDIKTI Wilayah XVI dibentuk melalui Permendikbud Nomor 34 Tahun 2020 yang membagi wilayah kerja LLDIKTI Wilayah IX yang awalnya meliputi enam provinsi di pulau Sulawesi. LLDIKTI Wilayah IX saat ini melayani Provinsi Sulawesi Selatan, Sulawesi Tenggara dan Sulawesi Barat. Adapun LLDIKTI Wilayah XVI melayani provinsi Sulawesi Utara, Sulawesi Tengah dan Gorontalo. Pada awal berdiri, LLDIKTI Wilayah XVI dipimpin oleh Prof. Dr. Ir. Mahludin H. Baruwadi, MP yang dilantik pada tanggal 22 Oktober 2020. Pada tanggal 7 Juni 2022, kepemimpinan LLDIKTI Wilayah XVI dilanjutkan oleh Munawir Razak.